El Rector es la máxima autoridad ejecutiva del Colegio Sagrado Corazón de María.
Actualmente la Rectoría está conformada por el Presbítero Darío Gonzalo Martínez Machado, quien representa la Dirección administrativa y Docente de la Institución.
Tiene como responsabilidad que el Colegio ofrezca servicios educativos que respondan a la formación integral de los estudiantes bajo la filosofía institucional y bajo los principios cristianos enseñados por la Iglesia Católica. Además, promueve continuamente el mejoramiento de la calidad educativa, la ejecución del Proyecto Educativo Institucional y ejecuta las decisiones de los órganos del gobierno escolar entre otros.